我来解释一下背景吧。

很久以前大部分人拿固定工资的时候，按月计发工资、按月计缴个税很合理也很容易。速算扣除表在大部分人事和会计手动算账的年代是自然而然的产物，老会计很熟悉这个表。
后来一些企业开始搞绩效制度，年终奖金额比例很高，如果按以前那样在当月计缴个税，就会导致当月个税非常高，所以个税制度跟不上社会发展需求了。

为了缓解这种矛盾，税务局研究后出了一个红头文件给“全年一次性奖金”单独搞个暂时性的优惠算法，思路是把奖金摊到 12 个月。如果完全按照这思路，应该把奖金平摊到 12 个月加到月度工资上，即适用月度工资的边际税率（超出档次部分还要上更高的税率），压根不该减速算扣除数。但这样实操太麻烦了，所以税务局才选了个容易理解和操作的简易算法（老人事和老会计很熟悉），而这个简易算法在正常情况下都是优惠的
——是的你没看错，哪怕在踩坑情况下都是*优惠*的，请尤其注意这一点！

楼上有些人拍脑袋说什么把速算扣除数乘以 12 云云，压根没理解该算法的本质。
如果要简单粗暴地修正 bug ，那么应该直接不扣速算扣除数才对。之所以宁可造成 bug 也要给个速算扣除数，无非是考虑到有少数人年终奖比例畸高，除以 12 的税率档次仍高于月度收入的边际税率，所以象征性地减个速算扣除数平衡一下。
至于更复杂的算法，请考虑到 2005 年时全国税务数据还没打通，人事财务电算化水平也不高（不少是手工计算，就连 Excel 2003 单元格公式也有 1024 个字符限制），复杂算法实操不可行。

现在个税改成年度综合收入纳税之后，理论上“全年一次性奖金”单独处理的理由已经不复存在了，现在无非是经济不好，所以打折“延续”的名头行税收优惠之实罢了。等哪天经济好了，这个优惠就该取消了。

最后再说一句，不要质疑国税总局在制定税收政策的专业程度，尤其是设计计算方法和权衡实操方面，至少不会比 V2EX 上任何程序员弱鸡。